공주대와 공주시는 지난 2012년 10월 25일 공주의 역사를 비롯한 문화, 교육, 행정, 정책 등과 관련된 연구를 수행하는 공주학연구원을 건립하기 위한 협약을 체결하고 동 협약에 따라 현재의 부지에 공주시의 보조금을 지원 받아 2013년 12월 설계를 완료하고 2014년 4월 착공하여 10개월의 공사 끝에 2015년 2월 완공했다.
이 건물은 건축면적 479㎡, 연면적 706㎡, 지상 2층 규모의 총 사업비 30억 원이 투입된 철근콘크리트조와 목조 한옥건물이다. 1층은 행정실, 세미나실, 아카이브 작업실, 자료실과 문서고가 위치하고 있으며, 2층에는 원장실, 연구실 및 대회의실(고마나루실)을 배치했다.
특히, 이 건물은 남향으로 주요 목재는 국내산 육송과 수입산 더글러스를 사용하였고, 전면에 전통식 담장을 축조하여 한옥의 풍미를 더 했다. 기와지붕은 전통 한식기와를 사용하여 합각지붕과 맞배지붕으로 구성하는 등 한옥의 멋에 채광과 단열 기능을 추가된 세련된 목조 한옥건물이다.
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